Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CUL3Q13618 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
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