Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 NTNG1-207ENST00000370073 3347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MFAP4-201ENST00000299610 1873 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MFAP4-203ENST00000497081 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 DGKZP1-201ENST00000378718 2776 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 NLRP2-206ENST00000427260 3411 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 KLHL30-201ENST00000409223 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PCSK7-215ENST00000540028 3332 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC023355.1-202ENST00000612262 4242 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 HNRNPF-207ENST00000544000 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ZNF789-209ENST00000483089 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 NEFM-204ENST00000518131 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SOX13-203ENST00000367204 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC012676.5-201ENST00000624337 1955 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 GUCY1A3-205ENST00000506455 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 FOXD2-AS1-201ENST00000445551 2509 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ATP6AP1-210ENST00000619046 2823 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CLK3-201ENST00000345005 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 IL1R2-201ENST00000332549 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC010969.1-201ENST00000340444 2412 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 TRPC7-203ENST00000502753 2424 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.9 ms