Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms