Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms