Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 TPM3P7-201ENST00000338274 732 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 IGLV2-33-201ENST00000390302 412 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 PGAM1P10-201ENST00000402426 761 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRCA2P51587 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 LMX1A-203ENST00000367893 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 FP325317.1-201ENST00000539936 1042 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 AL354704.1-201ENST00000629369 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 CREB5-205ENST00000409603 1944 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 SNAP25-AS1-202ENST00000426491 804 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 DNM1P50-201ENST00000565767 508 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRCA2P51587 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRCA2P51587 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BRCA2P51587 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRCA2P51587 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BRCA2P51587 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC15.05■□□□□ 0
BRCA2P51587 PTMAP5-202ENST00000607242 1162 ntBASIC15.05■□□□□ 0
BRCA2P51587 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
BRCA2P51587 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRCA2P51587 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRCA2P51587 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC15.05■□□□□ 0
BRCA2P51587 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BRCA2P51587 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BRCA2P51587 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRCA2P51587 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRCA2P51587 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BRCA2P51587 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRCA2P51587 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BRCA2P51587 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.05■□□□□ 0
BRCA2P51587 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRCA2P51587 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRCA2P51587 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRCA2P51587 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 RN7SL5P-201ENST00000581458 321 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 AL033381.2-201ENST00000603854 732 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 AC017100.1-201ENST00000565978 1169 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCA2P51587 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 IDH3A-207ENST00000558554 1595 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 EEF1GP2-201ENST00000509352 1243 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRCA2P51587 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms