Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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