Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GGCXP38435 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GGCXP38435 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms