Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM23P36406 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM23P36406 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM23P36406 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM23P36406 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM23P36406 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM23P36406 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM23P36406 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRIM23P36406 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRIM23P36406 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRIM23P36406 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRIM23P36406 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRIM23P36406 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRIM23P36406 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRIM23P36406 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRIM23P36406 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms