Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA13P31271 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms