Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGA6P23229 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms