Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms