Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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CLDN9O95484 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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CLDN9O95484 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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CLDN9O95484 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CLDN9O95484 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CLDN9O95484 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CLDN9O95484 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CLDN9O95484 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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CLDN9O95484 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CLDN9O95484 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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