Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PPARGC1AQ9UBK2 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PPARGC1AQ9UBK2 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PPARGC1AQ9UBK2 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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