Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms