Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms