Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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UBE2E2Q96LR5 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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UBE2E2Q96LR5 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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UBE2E2Q96LR5 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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UBE2E2Q96LR5 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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UBE2E2Q96LR5 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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UBE2E2Q96LR5 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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UBE2E2Q96LR5 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
UBE2E2Q96LR5 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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UBE2E2Q96LR5 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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UBE2E2Q96LR5 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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UBE2E2Q96LR5 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
UBE2E2Q96LR5 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
UBE2E2Q96LR5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
UBE2E2Q96LR5 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
UBE2E2Q96LR5 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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UBE2E2Q96LR5 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
UBE2E2Q96LR5 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
UBE2E2Q96LR5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
UBE2E2Q96LR5 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
UBE2E2Q96LR5 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
UBE2E2Q96LR5 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
UBE2E2Q96LR5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
UBE2E2Q96LR5 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
UBE2E2Q96LR5 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
UBE2E2Q96LR5 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
UBE2E2Q96LR5 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
UBE2E2Q96LR5 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
UBE2E2Q96LR5 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
UBE2E2Q96LR5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
UBE2E2Q96LR5 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
UBE2E2Q96LR5 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
UBE2E2Q96LR5 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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