Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 BLZF1-201ENST00000329281 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 POM121L6P-201ENST00000441186 1826 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 LINC00668-204ENST00000580197 2343 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ZNF479Q96JC4 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms