Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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