Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms