Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms