Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APTXQ7Z2E3 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms