Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 DFFB-201ENST00000338895 3105 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 DNAJB12-204ENST00000461919 2369 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 RPS10P7-201ENST00000441932 2329 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 AP1M1-203ENST00000444449 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 BCL6-211ENST00000621333 3399 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 ADCK1-202ENST00000341211 1972 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 MRO-203ENST00000428869 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 TMEM185A-210ENST00000613273 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 CLK3-201ENST00000345005 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 CD36-207ENST00000432207 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 IL12A-AS1-203ENST00000497452 2425 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 ACCS-201ENST00000263776 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms