Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

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Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTC1Q2NKJ3 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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