Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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