Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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