Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREMQ03060 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREMQ03060 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CREMQ03060 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CREMQ03060 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CREMQ03060 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CREMQ03060 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CREMQ03060 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CREMQ03060 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CREMQ03060 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CREMQ03060 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CREMQ03060 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CREMQ03060 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CREMQ03060 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CREMQ03060 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CREMQ03060 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CREMQ03060 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CREMQ03060 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CREMQ03060 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CREMQ03060 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CREMQ03060 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms