Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX3P78415 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX3P78415 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX3P78415 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX3P78415 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX3P78415 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX3P78415 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX3P78415 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IRX3P78415 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRX3P78415 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRX3P78415 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms