Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USP46P62068 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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USP46P62068 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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USP46P62068 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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USP46P62068 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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USP46P62068 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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USP46P62068 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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USP46P62068 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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USP46P62068 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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USP46P62068 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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USP46P62068 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP46P62068 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP46P62068 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP46P62068 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP46P62068 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP46P62068 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP46P62068 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP46P62068 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP46P62068 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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