Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIRAP54198 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIRAP54198 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIRAP54198 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIRAP54198 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIRAP54198 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIRAP54198 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIRAP54198 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIRAP54198 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIRAP54198 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIRAP54198 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIRAP54198 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIRAP54198 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIRAP54198 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIRAP54198 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIRAP54198 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIRAP54198 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIRAP54198 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIRAP54198 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIRAP54198 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIRAP54198 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIRAP54198 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIRAP54198 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIRAP54198 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIRAP54198 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIRAP54198 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIRAP54198 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms