Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MT1G-204ENST00000569500 305 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 SMIM6-202ENST00000579469 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 AC012313.2-201ENST00000599952 1154 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 SERPING1-213ENST00000619430 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 PAX6-255ENST00000639386 1723 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NESP48681 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 FAM96A-201ENST00000300030 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 AIMP2-203ENST00000400479 1107 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 AC092100.1-201ENST00000435148 702 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 CDCA4P3-201ENST00000442572 689 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 AC108082.1-201ENST00000510857 331 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 DHRS4L1-201ENST00000558293 855 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 AC016526.4-201ENST00000636059 517 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 ATXN10-212ENST00000640901 1185 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 GOSR2-231ENST00000640007 1425 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 CYP2B7P-201ENST00000541697 1476 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NESP48681 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 PRRX2-AS1-201ENST00000440413 429 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 AC010894.2-201ENST00000444196 561 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 AC069503.1-201ENST00000538710 816 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 AC021594.2-201ENST00000592499 527 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 FAM90A22P-201ENST00000400142 1395 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 ZNF114-201ENST00000315849 2206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 AP001341.1-201ENST00000409758 763 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 AL121983.2-204ENST00000430592 448 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 AL353803.1-201ENST00000439014 800 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 ACP1-207ENST00000439645 605 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 FTLP16-201ENST00000446400 513 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 AC006372.1-201ENST00000449903 546 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 TSACC-206ENST00000466306 477 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 AC022424.2-201ENST00000514848 454 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 AP3M2-205ENST00000517922 1094 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 AC106782.3-201ENST00000563429 258 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 AC002519.2-201ENST00000563575 539 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 RN7SL678P-201ENST00000579533 299 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 AC097634.2-201ENST00000615819 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 LINC00923-208ENST00000621777 503 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NESP48681 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 KRBOX4-203ENST00000377919 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 IGLV3-21-201ENST00000390308 602 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 MTND6P7-201ENST00000433237 524 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 AC109830.1-203ENST00000506638 467 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NESP48681 AC002351.1-201ENST00000546852 590 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms