Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMPOP42166 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPOP42166 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms