Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GGCXP38435 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GGCXP38435 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms