Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms