Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 GRID1-201ENST00000327946 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 LINC00668-204ENST00000580197 2343 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 BACH2-210ENST00000537989 9108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 FUT8-204ENST00000394586 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 SMARCE1-202ENST00000348513 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ARHGAP20-202ENST00000524756 6180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 GREB1L-202ENST00000424526 6052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 FBXO9-202ENST00000323557 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 GOLGA6L2-202ENST00000345070 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 BLZF1-201ENST00000329281 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 EPHB6-202ENST00000422643 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 TRERF1-202ENST00000354325 4138 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 POLR2J4-202ENST00000427076 6466 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 KCNV1-202ENST00000524391 6979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 VDR-202ENST00000395324 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 ITPRIP-203ENST00000358187 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 OTOG-203ENST00000399397 9948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
IFITM1P13164 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms