Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 PAX6-255ENST00000639386 1723 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 AL512488.1-201ENST00000433544 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC013269.2-201ENST00000422631 727 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC108102.1-201ENST00000606528 548 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DMDP11532 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC009238.3-201ENST00000512705 217 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC011389.2-201ENST00000514811 365 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 CST2-201ENST00000304725 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 AL008719.1-201ENST00000430449 473 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 AP003096.1-201ENST00000565199 503 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC010601.1-201ENST00000569048 446 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC093072.1-201ENST00000589196 602 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DMDP11532 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 RPL18P1-201ENST00000497218 552 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 DHRS7-202ENST00000536410 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 RPL26-206ENST00000582556 763 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 IDH3A-207ENST00000558554 1595 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 AL049792.1-201ENST00000424708 1262 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC109466.1-201ENST00000517508 804 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 AP005203.1-202ENST00000584204 561 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DMDP11532 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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