Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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