Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
UBE2D4Q9Y2X8 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms