Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CLIP2Q9UDT6 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CLIP2Q9UDT6 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms