Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms