Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms