Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXQ1Q9C009 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXQ1Q9C009 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.2 ms