Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLVAPQ9BX97 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms