Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SGCZQ96LD1 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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SGCZQ96LD1 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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SGCZQ96LD1 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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SGCZQ96LD1 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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