Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COG3Q96JB2 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms