Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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RNF148Q8N7C7 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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RNF148Q8N7C7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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RNF148Q8N7C7 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RNF148Q8N7C7 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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RNF148Q8N7C7 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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