Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 TSACC-203ENST00000368253 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC093627.3-201ENST00000467050 574 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC017100.1-201ENST00000565978 1169 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 FXYD3-210ENST00000604621 548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 RN7SL460P-201ENST00000582806 258 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 MECP2-226ENST00000640414 897 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 PNLIPRP2-201ENST00000579578 1482 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 MIR4435-2HG-201ENST00000308604 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 HNRNPA1P68-201ENST00000425806 979 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 CNN2P1-201ENST00000453616 918 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC078925.1-201ENST00000535370 568 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 GLIPR2-201ENST00000377959 812 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC027290.1-201ENST00000537827 484 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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