Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PRAMEF20Q5VT98 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PRAMEF20Q5VT98 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PRAMEF20Q5VT98 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PRAMEF20Q5VT98 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PRAMEF20Q5VT98 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PRAMEF20Q5VT98 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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PRAMEF20Q5VT98 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PRAMEF20Q5VT98 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PRAMEF20Q5VT98 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PRAMEF20Q5VT98 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PRAMEF20Q5VT98 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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PRAMEF20Q5VT98 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PRAMEF20Q5VT98 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PRAMEF20Q5VT98 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PRAMEF20Q5VT98 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PRAMEF20Q5VT98 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PRAMEF20Q5VT98 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PRAMEF20Q5VT98 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PRAMEF20Q5VT98 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PRAMEF20Q5VT98 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PRAMEF20Q5VT98 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PRAMEF20Q5VT98 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PRAMEF20Q5VT98 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PRAMEF20Q5VT98 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PRAMEF20Q5VT98 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PRAMEF20Q5VT98 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PRAMEF20Q5VT98 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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