Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC96Q2M329 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms