Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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HERC3Q15034 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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HERC3Q15034 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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HERC3Q15034 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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HERC3Q15034 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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HERC3Q15034 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERC3Q15034 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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