Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FOXD4Q12950 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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FOXD4Q12950 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FOXD4Q12950 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FOXD4Q12950 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FOXD4Q12950 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FOXD4Q12950 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXD4Q12950 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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